Desde la década de los noventa, el acervo del MACG se ha nutrido con la incorporación de diversas obras que tras ser exhibidas en el recinto han sido donadas por las y los artistas participantes. De esta manera, y a través de otros mecanismos de incorporación de obras como el programa de Pago en Especie (establecido desde 1957 por la Secretaría de Hacienda y Crédito Público); donaciones a través del FONCA (Fondo Nacional para la Cultura y las Artes); o donaciones voluntarias; el MACG ha logrado sumar una destacada colección de arte contemporáneo a su acervo fundacional.  

La colección contemporánea del MACG, actualmente conformada por 799 obras, se continúa enriqueciendo con la intención de resguardar un panorama de la propia historia expositiva del recinto al tiempo de contribuir a la narración de la historia del arte mexicano reciente.